1511.-
1537. - Obrambene kule i zidine oko katedrale daju izgraditi biskup
Luka Baratin i
Šimun Erdody (1518.-1543.), a kulu (Bakačeva kula) s obrambenim zidovima ispred same katedrale dao je 1517. podignuti ostrogonski nadbiskup i upravitelj Zagrebačke biskupije, kardinal
Toma Bakač. Biskupska utvrda iz prve polovice XIII. st., prostrana pravokutna kula na istočnoj strani iza svetišta katedrale, povezana je 1511.-1521. s ostalim obrambenim kulama i zidovima u jedinstvenu renesansnu katedralu-utvrdu. To je ujedno bio glavni ulaz u katedralni sklop. Katedralna utvrda odoljela je dugom opsjedanju katedrale i biskupske kule 1528./29. u doba građanskoga rata za hrvatsko-ugarsko prijestolje. Plemstvo i Zagrebački Gradec bili su za
Ferdinanda Habsburškog, a Kaptol za
Ivana Zapolju. Ferdinandovi španjolski vojnici generala Turna su tada iz Gornjega grada teško oštetili zvonike i samu katedralu.